首先，增值税是按你开具的（发票金额/1.06）*0.06所得的数就是你应缴纳的增值税。收到的增值税专用票不能抵扣，但如果是购买的税款收款机可以按专用票上税金抵扣增值税，不足抵扣的可以留抵下月。
所得税是按收入减去成本费用后计算利润总额，再加减调增调减项目，计算应纳税所得额，然后乘以税率就是应交所得税。我建议你在应交税金项下列子科目，可以有增值税、应交所得税、城建税等等。
关于发票，各地可能管理部一样。有的地方要求2、3个月缴销一次发票，没用完的也要缴回去，再购买新的。
网上报税就是把当月的数据录入后，发送就行了，然后打报表，送到税务局。如果办理了银行自动扣款，就不用带钱了。如果没有，还要去税务局打票、交钱。
还有就是外面开来的增值税发票不能记进项，应该作为成本或费用。按常理说，你是小规模纳税人，对方不应该给你开专用票的。