1.关于资金投入。分公司负责人一般作为股东投入，借“银行存款”，贷“实收资本”。总公司既可以资本投入方式，也可以往来款方式投入。
2.关于产品移交。
《增值税实施细则》规定：
第四条 单位或者个体工商户的下列行为，视同销售货物：
（三）设有两个以上机构并实行统一核算的纳税人，将货物从一个机构移送其他机构用于销售，但相关机构设在同一县（市）的除外；
也就是说，身处异地的总分公司之间，跨越税务机关管理区域的，应作视同销售处理，并开具发票。
小规模纳税人和一般纳税人不同之处在于，小规模不可以抵扣，一般纳税人可以抵扣。