根据《印花税暂行条例》及《施行细则》的规定，下列凭证为应纳税凭证：（一）购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证。条例第二条所说的建设工程承包合同，是指建设工程勘察设计合同和建筑安装工程承包合同，包括总包合同、分包合同和转包合同。

　　因此，若该公司建筑安装工程承包合同未实行核定征收方式，该公司应就其总包和分包合同金额合并计税，共应缴纳印花税（3500＋2000）×0.03%×10000＝16500元。